为了促进原创研究成果的不断产生，复旦大学与中国科学院上海药物研究所在2016年6月8日签订了战略合作协议，其中一个重要内容就是设立“复旦大学—中国科学院上海药物研究所战略合作自主创新课题融合基金”。根据去年申报、评审和立项之经验， 今年度依然设置“面向新药创制需求的基础研究”、“药物研发新方法和新技术”和“针对重大疾病新药创制的应用研究”三类项目。项目部署按照“顶层设计、广泛征集”的原则，采取“公开征集、自由申请、择优支持”的方式组织实施。遴选项目原则为符合复旦大学“世界一流大学和一流学科”的建设方针、中国科学院上海药物研究所实现“四个率先”的行动纲领，有利于践行“科教相长、协同育人”的理念和创造多赢成果。

2018年11月21日，复旦大学—中国科学院上海药物研究所战略合作自主创新课题融合基金2018年度项目评审会在复旦大学药学院晶晖厅举行。项目评审专家组由上海医药集团中央研究院沈竟康研究员，中国科学院上海药物研究所冯林音研究员、左建平研究员和林莉萍研究员，复旦大学药学院王明伟研究员、李聪教授和蒋晨教授组成。来自复旦大学药学院、基础医学院、生命科学学院、化学系、生物医学研究院和神经生物学研究所等6个二级单位的25位科研人员分别与中国科学院上海药物研究所的科研人员共组团队参加了项目答辩。整场评审会在严肃、认真的气氛中顺利完成，评审结果择日公布。